Protein
MCA_03560_1
Length
3,509 amino acids
Browser: contigC:341232-351762+
RNA-seq: read pairs 149, FPKM 0.5, percentile rank 7.0% (100% = highest expression)
Protein alignments
| %id | Aln length | E-value | ||
|---|---|---|---|---|
| A0A0J9X2E1_GEOCN | 51.47% | 68 | 2e-13 | Similar to Yarrowia lipolytica YALI0E18722p [Yarrowia lipolytica CLIB122], partial (Partial) (Fragment) OS=Geotrichum candidum GN=BN980_GECA01s00169g PE=4 SV=1 |
| UniRef50_A0A0J9X2E1 | 51.47% | 68 | 5e-10 | Similar to Yarrowia lipolytica YALI0E18722p [Yarrowia lipolytica CLIB122], partial (Partial) (Fragment) n=1 Tax=Geotrichum candidum TaxID=1173061 RepID=A0A0J9X2E1_GEOCN |
| A0A060TC00_BLAAD | 28.32% | 286 | 1e-12 | ARAD1B12870p OS=Blastobotrys adeninivorans GN=GNLVRS02_ARAD1B12870g PE=4 SV=1 |
| Q6C3B8_YARLI | 23.71% | 291 | 1e-11 | YALI0F00990p OS=Yarrowia lipolytica (strain CLIB 122 / E 150) GN=YALI0_F00990g PE=4 SV=1 |
Mitochondrial localization by mitoprotII
Probability of mitochondrial location: 0.0021
Protein family membership
None predicted.
Domains and repeats
None predicted.
Detailed signature matches
no IPR
Unintegrated signatures
-
CYTOPLASMIC_D... (C...)
-
NON_CYTOPLASM... (N...)
-
SIGNAL_PEPTIDE (Sig...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
TRANSMEMBRANE (Tran...)
-
mobidb-lite (disord...)
Protein sequence
>MCA_03560_1 MKLSRLLCAQGIFGVAYSALIPSEKRLAVKSPSEIQLQLNKDCEKPDLFLCLDACENFNNRMVLAEASSNLCTVLNENLD SLYHCIVCGSHYDELKAISERLIYYVETCNPDIPINEKCTDAYNDRGSSHLIARQNMCEGGTDNCLGNCGVLVSRLLLSL ITFSLCRTIGGVLDSLTDCLLCGGLSTISDVLVNELIGCGFNMDPCTTSTEALPPNTGIPEKCITNAPDFGTCFSSCANL IPTILAAVGTLNVCNIVADATDSLTLCLLCGALFPAVNGLISGVVLDTLVGCDFDTAITCNDGPPPSSEIERALPTGNVP ANCNTEALDADSCLAQCGVLIPRILTAVGSVQICEIVNQSTDALTVCLLCGALFPLVNNLITGVVLERLVGCDFDTRINC GVDSISSSQNSLTPPTDIPEGCNTQAIDSVSCYSKCSVLISNILAATGTVEVCGIVNEATDSLTECLLCGALFPFVNELI TGVLLERLIGCNFDTQITCNAVVSVSSSSSDSIMPFPTTVPEGCNTDAVDADSCLETCSTLITRILTAVGSLQICEIVNQ STDSLTQCLLCGALFPIVNQLITGVVLERLVGCNFDTKVKCIISSSSISISSLPDFSSASDSSDALHISSNDASSIDSVS ISSSFAFSNSISSNSIMASESNSLSSSSTIQSISEIESTEINSMDQSSSHDKTLTSNSDFQISSASGTGIDASSTSAGIP SSSSNDRNIPPTAVIPNPCNTASLQEYWCIKKCYSVMTDVDNSATCAELTPIAEDISTCLICASVFLTVEQQLQDSFRPK LQECGMGIMTSLCPSTTSTPTAVVPDPCDTMTYDDELWCFRFCDGVTYQILDLPECEQVLSRSNDVNICLTCGKTFPEVD QQIPDAFRTRAQQCGVKDILEQCLSLSTITSTSSIEASYSSTTFSSMNPETTNGVTSSTPDPCDTMTYDDEFWCFRFCDR VMYQILDLPECEQVLANSNDINICLTCGKTFPEVDQQILDEFRTRAQQCGVKDILDQCISSSSISSTFSIESTDSFIEAS DSSITTSAYSTLSLETSLSIDPGTTSSATSSTPDPCDTMTYDDEFWCFRFCDRVMYQILDLPECEQVLANSNDINICLTC GKTFPEVDQQILDEFRTRAQQCGVKDILDQCISSSSISSTSSIDSTFSTIDSSTELSDKITTASSTDNSGASSTDSSSAS STDGAGASSTNDYSASSTDNSNGLSTDSSAASSTDSSDASSSDGSATSSTDNSGASFTDGASASSTNNSGASSSDSSGAS STNSSDASTTDRSAASTTDGSNASSTDGSNTSSTNNSGASSTNDSSASSTDSSNASSIESTSASSTDSASASSTDSSSAS SSDGSGASSSDNSSASSTDSSGASSTDGSAASSSEGSSASTTDSATASSTDSSSTSSSDGSGASSTNNSGASSTDSSDAS TTDSSNASSTDGSSASSTNNSGVSSTDRSAASTTDGSNASSTDGSNTSSTNNSGASSTNDSSASSTDSSNASSTDSASAS STDSSSALSSDGSGASSTNNSGASSTDGARASSTNSSAASSTNGSGASSTESANLSSSNVAGASSTDGGQVGPTGPFTTG SAGASSTDNSGASSPDSSSVSQTDSSAASSTDGATASSTDSSGASSTGSAGASSTENSDASSTDGGQVVPTGPSTTDGAG ASTTDGTGASSTDKSGVSSTDSTSDPSTNGASASSTNGANVSSNDSAGVSSTDDYGASSTDGGQVGPIGPSTTQGAGSSS IDSASASSTNGLGSSSTDGSGVSSTDSSGPSSTDNASASSTESSGASSSNGSGASSTDGSSASSTDGSAASSSEGSSAST TDSASESSTDSSSASSSDGSGASSTNNSGASPTNSSAASSTDSSGASSTDGSDASSSDGSAASSTDGSSASSTGNSDASS TDNSGVSSTHGSGASSTDSSGASSTDGSGASSTDSSGASSSDGSAASSTDGAGASSTDNSNASSTDSSGASSTHSSGVSS TDGAGTPSTDNSNASSTDSSGASSTDNSNASSTDSSNASSTDSSDASSTDNSGVSSSNGSGASSTNNSGASPTNSSAASS TDSSGASSTDGSGASSSDGSAASSTDGSSASSTDSSDASSTDNSSASSTDGSSASTTGNSDASSTDSSGVSSSNGSGASS TNNSGASPTNSSAASSTDSSGASSTDGSDASSSDGSAASSTDSSSASSTDSSDASSTDNSSASSTDGSSASTTGNSDASS TDSSGVSSSNGSGASSTDSSNASSTDSSGASSTDSSDASSSDGSAASSTDGSSASTTDNSNTLSTDSSDASSTDNSGVSS TYGSGASSTHSSGVSSTDGAGTPSTNNSSVSSTDNSNASSTDSFNASSTDSSGVSSTDNSNASSTDSSGASSTDSAGASS TDGAGASSTDKSGVSSTDSTSDPSTNGASASSTNGANVSSNDSAGVSSTDDYGASSTDGGQVGPIGPSTTQGAGFSSIDS ASASSTNGLGSSSTEGSGASSTDNSGPSSTDNASVSSTDSSGASSNDGSGVSSIDSSGASSTESAGVTSSTDGSGTSSSD GGQVGPIGPSTTDGSGASSTDGPSSTQVQSSVGTSTTDGAVSSSTDGAGASYTDSFSISSTDDAGVTTTQGQGSVGPSLT DGAGSSSSTDGQVGPTGPSTIGSASFSSASISYSISNSIDSSSTAPYSSSTSDSHSASLVSSPTDSEFSSIISLSSSTVT TDTFTPPTFAYTFTNTSILQTQSFTVSSPVEFTSSWDTIESSEILTDSSSSFYSEGSAITSSIPALSSSSGSPNTGSITS ESNSMEPTSVSTSTDDGGILPNPGSTSDGKEDTSTYVSTSSDDGAVLPNPASTSTDTIATTSISTSSESGAVLPNPASTS TGSETTSVTKSSDDGSSLSISASTSADTLVSMTSSSSAISSNPALTSTESGTSVVSSSSNSGDNLPNPASTSTGAGNTFV SVSTFSNGGSIPSGSSSASSDGTATSSVSASSSDNGGILPNPASTSASGTSTSVSTSSDDGAVLPNPESTSTNTIATTFV STSSDNGGILPKPASTSTSSETTSLFTSSDGGAILPKPASTSSDRDFTTSVPAPTSGNTGNNGGNNGGNNGGNNGGNNGG NNGGNNGGNNGGSTSPGQGSGDGNGSSPGQGSGNNGNNDGSLLPGQQSPGNDNGTGSTNPGSGNNNNNNNNDGDGSALPG QQNPGNGDNSGNNGNNGSGNNSNNGDNDNGSSLPGQQVPGSNNNGNNNSNGSGNSGTGTNGSADNNNDDGSISPGQQGPG NDGDDGSTLPGQQQQNGNGNNGGGNNGGSSVLPGQDGTAPGSGNNGSNGNNDGNDLSGQQQPDTSGNNGNGSNDDDNGSI LPGQQRPGTNDNNNNNNNNDDSSSSSGPAINLPGQSGNNNNNNGDNNSVAPDSNNNNNSSGNNSNDNSSPSSSSSDNNDD DTNGSSSSNDNSVLPNDKNNDLFDNSQPNQVSPSSPLLDQVNSAYSSKTSNLALSVGITLSACFFLVMI
GO term prediction
Biological Process
None predicted.
Molecular Function
None predicted.
Cellular Component
None predicted.