Protein
MCA_03258_1
Length
3,743 amino acids
Browser: contigB:3835357-3846589+
RNA-seq: read pairs 1202, FPKM 4.0, percentile rank 15.7% (100% = highest expression)
Protein alignments
| %id | Aln length | E-value |
|---|
Mitochondrial localization by mitoprotII
Probability of mitochondrial location: 0.0356
Protein family membership
None predicted.
Domains and repeats
None predicted.
Detailed signature matches
no IPR
Unintegrated signatures
-
CYTOPLASMIC_D... (C...)
-
NON_CYTOPLASM... (N...)
-
SIGNAL_PEPTIDE (Sig...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
-
TRANSMEMBRANE (Tran...)
-
mobidb-lite (disord...)
Protein sequence
>MCA_03258_1 MKLISSLAFFVGALQLQSSLASPIVNLPERFDKSFTTQNNASDFFDKMNLKMKRQQNAQCPDAVEINSSSCVPDISGFTN KECNLWCHYVYLEAQQYGQGGSICDSNGDLYPDLVYVNGHFEVCIRCSDGLGLKYGDEIQMLAQECTSGFNTQDCSDASL IIGDGTYSQYYEPNGCGSYCSDFIQTTWDEHNDGNTEDETFFACWDLMYFGEILSACKFACTDPIDNWNLIEKMTENCPY FYPDTFWTENMCIIEPVSSTILTTTTTSTTLKPASSSNKISSIKTSSEQGTSNASSLNSNIGLPTSENSNTIGGGTSSTD SSVAVSTNSPGASSTGGAGTSSTGSAGASSNNGSGASSNNGSGASSTNGSGASSTGGTGASSNNGSGASSNNGSGASFTG GFEASSTGGSGASSTGGSGASSNNGTGASSNNGSGASTTNGSGASSTGSAGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGASSNN GSGASSIGGAGVSSNNGSGASSNNGSGASFTGGFEASSTGGSGASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTGSSGASSTG GSGSSATNGSGASSNNGSGASSTGGSEASSTGDSGTSSTGSAGASSNNGSGASSTNASGASPTGGFGASSTNGSGASSTG GSGASSTGGSGSSATNGSGASSTNGSGASSTGSSGASSTGGSGSSATNGSGASSNNGSGTFSTGGSGASSTGSAGASSTN GSGASSNNGSGAFSTGGFGASSTNGSGASSIGGAGVSSNNGSGASSNNGSGASFTGGFEASSTGGSGASSTGGSGASSTG GAGASSNNGSGASSTGGSRASSTGGAGPSSTNGSGTSSTGSSGASSTGGSGSSATNGSGASSNNGSGTFSTGGSEASSTG GSGASSTGGAGASSNNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSNNGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGASSTG GFEASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSNNGSGASSTGGSEASSTGGSGASSTGSSGASSTGGSGSSATNGSGASSTN GSGAFFNNGSGASSTGGSEASSTGGSRASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGASSTGGSRASSTGGAGPSSTNGSGTSSNN GSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGAFSTGGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGTSSTNGSGASSTGGAGASSTN GSGASSSNGSGASSTGGSEAFSTGGAGASSTNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTNGSGASSTGGAGASSNN GSGASSNNGSGASSTNGSGASSTGGSGASSNNGSGASSNNGSGASTTNGSGASSTGGSGASSTGGSGAFSNNGSGASFTG GSEASSTGGSGAFSTGGAGASSTNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGASTTN GSGVSSTGGSGASSTGGSGSSATNGSGSSSTNGSGASSTGGSGASSNNGTGASSTGGAGTSSNNGSGASSTGGSGASSTG GAGASSNNGSGASSTGSSGASSTGGAGASSTNGSGASSTNGSGVSSTGGADASSNNGSGASSNNVSGASSTGGSGPSSTN GSGAFSNNGSGASFTGGSEASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSNNGSETSSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSTN GSGASSTGGSGASSNNGTGASSTGGAGTSSNNGSGASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTNGSGASFTGGSEASSTG GAGASSNNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSNNGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSNN GSEASTTGGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGASSTGGSGPSSTNVSGAFSNNGSGASFTGGSEASSTGGFGASSTG GAGASSANGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGASSTGGSGSSATN GSGASSNNGSGAFSTGGSEASSTGGAGASSTNGSGASSTGSSGASSTGGSGSSATNGSGASSNNGSGTFSTGGSEASFTG GSGASSTGGAGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGSSATYGSGASSNNGSGTFSTGGSEASSTGGSGASSTGGSGASSTG GAGASSNNGSGASSTGGSRASSTGGAGVSSNNGSGASSTGGAGASSNNGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGTSSNN GSGASSTGGAGASSNNGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGSGASSTGGFEASSTGGSGASSTGGSGASSTG GAGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGTSSNNGSGASSTGGAGASSNNGSEASSTGGSGASSTGGAGASSNN GSGASSNNGSGASSTGGFEASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGASSTGGAGASSTN GSGASSNNGSGAFSTGGFGASSTNGSGASSIGGAGVSSNNGSGASSNNGSGASFTGGFEASSTGGSGASSTGGAGASSTN GSGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSTNGSGASSIGGAVVSSNN GSGASSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGASSNNGSGASSNNGSGASTTNGSGASFTGGSEASSTGDSGASSTGGAGASSTN GSGASSNNGSGAYSTGGSGASSTNGSGASSTGGAGAPSNNGSGASSTNASGASPTGGFGASSTNGSGASSTGGAGTSSNN GSGASSNNGSGAYSTGGAGASSNNGSGASSNNGSEASFTGGSGASSTGGAGATSNNGSGASSNNGSGASPTGGFGASSTN GSGASSIGGAGVSSNNGSGASSTNGSGASSTGGSGPSSNNGSGASSTGGAGTSSNNGSGASSTNGSGASSIGGAGASSNN GSGASSNNGSGASSTGGSGPSSTNGSGASSNNGSGAFSTVGSEASSTGGSGASSTGGAGASSTNGSGASSNNGSGASSTG GAGASSNNGFEAFSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSNNGTGASSTGGAGTSSNNGSGASSTGGSGASSTGGSGASSTG GAGASSTNGSGASSTNASGASPTGGFGASSTNGSGASSIGGAGVSSNNGSGASSTGGSGASSTGGAGASSNNGSGASSTN GSGASSTGGSGAFSTGGSGASSTGCSGASSTGGSGASSTNGSGASSTGGAGASSTNGSGASSTGGAGASSNNGSGASSTN GSGASSTGGSGASPTNGSGAFSTGGSGSSSTNSSGALSTNESAAFSTSGAGASSFTDGSFVSSNGIVSTTLSVGTSASSH TNSRFSSVDGSTVSSSEGSCKSGSLLTRTISTAQRSSLYTPDSLTSSASDVSTISGSPVVTITSTRPAGSTETGTSTISE PGAGTITLIVPPVSDNAKSTISSRYSFTTSIIKQSPSHTFTHFTNATYTSLSAPSNIIQSLPQNSDHTAMSESSHSTTAP HATQSLILSAPPSQSGVGNQALPSKPDSKQQDVASTPIIQTSSNQNIIPNSKGNGSLGGQNTNQDTDIVQKPTSGINSNT NTGDTNSDGSNKHGESVPNTGQFQPGQDTSNDQTSPGSNKNPSSTNPDNSSNSQHGSDVEPHLNPENPGHNTANSGNDSN DSSGNNFDSSGHESGANNGQISQGNPLENSNDHPPIDQANEGTTLSSHTMIGFIIAFAIVYLS
GO term prediction
Biological Process
None predicted.
Molecular Function
None predicted.
Cellular Component
None predicted.