Protein
MCA_03208_1
Length
3,119 amino acids
Browser: contigB:3663378-3672738-
RNA-seq: read pairs 82, FPKM 0.3, percentile rank 5.9% (100% = highest expression)
Protein alignments
| %id | Aln length | E-value |
|---|
Mitochondrial localization by mitoprotII
Probability of mitochondrial location: 0.0012
Protein family membership
None predicted.
Domains and repeats
None predicted.
Detailed signature matches
no IPR
Unintegrated signatures
-
CYTOPLASMIC_D... (C...)
-
NON_CYTOPLASM... (N...)
-
SIGNAL_PEPTIDE (Sig...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
SIGNAL_PEPTID... (S...)
-
-
-
TRANSMEMBRANE (Tran...)
-
mobidb-lite (disord...)
Protein sequence
>MCA_03208_1 MKASNCLLFALGGIQILGTNGYPIYDKHLQEDSIALEAISNRFFDTFIELDKRQTPITNTRCLPKLVTTSNACDNFCKVL YYALVREYQGTPGYDRDNLSVCFSNTGKLKNEEVLNFRSSLRICRQCGKTASTNYYKKVNNVFRDCKSNKFDDYLDYQVC EGCIDRTNAAADINPNSCRTSCQAVITHTESYLLSSDGTADWKSTSCWGLATNFYRLNACTNCPELTTAMRQRINKFTAD CDLVQSIQWLKVCPVVSSTTMLTSTTTSETSTIDEESTTSITEDYTTSAISEISKPTQESEQSSDVASSVIENPSSTGST KFSDEISTGIEPSSSFFSNDLESISDLVSTTNGITSDYVSSSNGFRFTNSTSSTNENTFSDGSSSTYAASSNDGASSTGS LSFSDRGSFNDSPSSSDGAFSSFDASLTDGASLTDGPSSSDGASSSDSPFSSDSPSPSDKVSFSDGASSSDRVSLTDSTS YSDSLSSSDSPSSSDSPFSSDSSSSSDSPSSTDSASSSGSASSSDGVSSSDGPLSSSSVSLTDTPSSSDSFSSSDSAFSS DGSYSTDDASSSNSLFSSDGASSSVSASSTDSPSSTDGASSSHGGSSSDSPSSNDSASYSDSPSSNVSPSSTDSASSSGS ASSSDGVSFSDGASYSDSVSLTDTPSSSDSASSSDGGSSAVDTSSTDIPSSSVSVFSSDGDSSTGSLSSTNRGSFSDSPS SSDGAFSSDGASSTGSLSSTNRGSFSDSPSSSDGAFSSDGASSTGSLSSTNRGSFSDSPSSSDGAFSSDGASSTGSLSST NRGSFSDSPSSSDDAFSSADTSLTDDAFLTESPFSSDGAPSSISVSLTDSSLSNDSPSLTDSPSSSDILSSADSASSSDP GSSSLTASSTESLSSSDDASSSKGISLTDSFSSSDSPSSTDEVPPTDGASFTDSSSSTNGVSSSDGGFSSASVSLTDSST SSGGGSSSDSPSTSDSPFSSDRVSSGDNPSSSDSPSTDGSSPSNSLSSSDGGFSSASISSTDSPSSSGSSSSSDSPSSSG GGSSSIIVSLTDSSSSTDGASSSDSALPTGRSSSSDSAVSSDGSFSSDEGSSSISVPLTTSALSSDISSSTNEDFSSDSS SSSDRVSFSDGASSSNSVFSTDTSSSSDSPSSSDSGFSSGSGSSSDSSLPTDSPSSTDSASSSDNASSRDSPSSNDSPFS TDSASSSVSTSSSDGVSFSDGASSSDSISSTDTPSSSDSPSSSDSASSSDKASSIDGGSSTDGASSSANASLTDVASSSD SPSSSNGAFTSVNVSLTDSPSSGDRSSSSDGGSFSDGTSSSDSPSSSDSASSSASVSLTDGASLTDSPSSTNGLSSSDSP SSSDGASFTGSYSSGDSPSSSNTPFSSDGGSSSVHASLTDGTSSTDSISSSDDATFTNSPSFTDSSSSTDSSSSSNDLSS SDSPSFTSSPSSSNAISSSVVTSSPNEVSFTEGPSSSDRDFSSIDVSATEGISSLDASSFSDGVSFSGGPSSTHSPSSTN SVSSSDILSSSINFSSSNSIASTDGFSFTGGPSFTGGGSSSAKASVTDGVVSSDTVATSHVPSSSNGVSTSYGSSFTNSI SSSHATSSSDGSSIIDGISSSDSAFSTDASSSNKGPSFTSGASSSSGSLSTTSLFSTDGPSSSIGISSSNPLSSSNGASS PDIVSSTDGAFSTFTDGPFISESLSSTDGASSSHDASFSDSSSSSYAASFSEGASSTNGVASSESPFSTDTVSSVDSISF TNGLSSTDGFSSSHSVSSTGEVSSSDRSSSNESFSSSGITLSTDGLSSPSYISSSEGAFSTYDPSSTEAVSSSNQFHSSD GISPTDHSVSTDGITSSAAESSTHVASSIHSSDASTTDEFGGSSINTFGSSSTDKSRTFSTNSLDQSTTEDSVVSSIESV GLSSTTSQIGPIGPSTTTELSFSFTDGSSALPTDRLSSPFTSSFSFQSTDGAGSSFTDGSSASATDESGITSTNSSGASF TDGPQFSSTIGASASTTERSGSSSTNYQASPIGPSTTNEPGFSSTDSSRTYSTGGSSNSFINSSDTSSNNKHSASSTNGP VASSTTSQVGPIGPSTTNESGASSTGDFVNSSINSSDTSSNDGQAGPIGPSTTETSSSSSTDIPSFSFTDRSVSSSTDGQ VGPIGPSMTNEPGASSTGSGNSSTNISNASSTDENGVSSTSASGSSSNDGQVGPIGPSTTDISSASSTKGSGASSTDGAS VLPTNNPGITSTDPVGASSTRSLSGSSIAIVTSTSFADSTKTETPIISNSNAQTASSIFSPSSNSFTEIFTRTTFSSIFS EVSSFSSSTSDTLSISSLQSSLAPSFTTYESSIHTSLTTHTSSPIPTLLPTFTIDECKPYCEYIDNQVGSVLNSDQRCRL LDSIDEQLLANCLLCLGQYTELYKPGEPAKKVFDSAVECSILPIQRGYNPIPIPGYTSSSSSITFSATSTTDPSQTLPPY TKDQCSTYCDYLTDELDKSTSFLQKCVVLGSPNEQYVENCLRCIESYPELTDPSQSGRKVKDQLGQCQLPIPTGPYEEVP LPSGGSYLSTGTKTSSSTGSIPTDGTFPPQSKCSLYCLYITQQLELSPVMEQCKTLTAIEEQIVANCFRCQEVYEQVAVS EPVRKVKEAFEQCNIAPSSRSYKDVDITVPKQSTGVTSSLLRTDGTSSLASTAGQGYTTGISKFTTRSDQNTLSSTSTQG GGQILPTNRPTQSSGSGNGGPGNNGSAPGSGNNGSSPGSGNNGSAPGSGNNGSAPGSGSSGSGSGSDGSGNKSSDSDGGQ IAPIGRPTRSSGSGTSGSGTDGSGNNGSGNNGSAPGSGNNGSAPGSGGSGDKGSDSDGGQIAPIGRPTQFPGSGSGSSDN NGSGPGTGDTGNDGSDTGINGNDNNGVGSGPGPDGSSNNGSGPGDNNGTGPGTDGSDNNSFNSGNSGSGNNGFGQGSNGS GDKGSDSDGGQIAPISRPTQIPGSNGQAQDNNSGFDSDTIGTDNENSKESGTNGNENNKLGAGNSSGLETEVGSQGTGLE LGSENLGSDPKARLESGWDDTNSNDAFGSGGLFGPNGSSASLDPLNSSGVLQSNSGQKVSVSFVSSWAILMSFIFYFLT
GO term prediction
Biological Process
None predicted.
Molecular Function
None predicted.
Cellular Component
None predicted.