Protein

MCA_03206_1

Length
1,082 amino acids

Browser: contigB:3655719-3658968+

RNA-seq: read pairs 3544, FPKM 40.4, percentile rank 60.5% (100% = highest expression)

Protein alignments

%idAln lengthE-value
MIA_00854_147.25%919e-13MIA_00854_1

Mitochondrial localization by mitoprotII

Probability of mitochondrial location: 0.1858

Protein family membership

None predicted.

Domains and repeats

None predicted.

Detailed signature matches

Unintegrated signatures no IPR
Unintegrated signatures
  1. CYTOPLASMIC_D... (C...)
  2. NON_CYTOPLASM... (N...)
  3. SIGNAL_PEPTIDE (Sig...)
  4. SIGNAL_PEPTID... (S...)
  5. SIGNAL_PEPTID... (S...)
  6. SIGNAL_PEPTID... (S...)
  7. SignalP-noTM
  8. TRANSMEMBRANE (Tran...)

Protein sequence

>MCA_03206_1
MFTTRTLKSFALGFLGLSSYVMAQEDELQGYVTSPAQLTVTVTSCPNIECHTPSVVVTVTECPVLYPSDAVTISYTTYET
VTEGQTVTVTKPQGTSFHPHAKPYTTILPTTIIYPGTTVPGVDIPGTTIPGSIIPGYTNPGTTIIGTTVPDRTEGGTTIP
GSQIPGTTIEPSTVSAHYVVTYYSTCTTSSEDQVITTTVPVTETVYITEKITMEVTKEIPTTIIQPTTETYVTTHFTISE
GKNITVTDTYTTAYTKTEVSTTTVVQPTTIYEPTTVVEPTTIVQPTTIVSTYETTYTTEKEGTPITVTEQIPTTIVLTET
QVQTQVQTEVHTEVQPTTLYETLVSTYATTYTTEKEGQTITVTEQIPTTIVQTQVLTEVHTEVQPTTIYETLVSTYATTY
TTEKEGQTVTVTEQIPTTIVHTQVLTEVKTELQPTTIISTVLSTYVSEKEGKPVTVTEQVPVTIVQTQVQTEVQPTTIIS
TVLSTYVSEKEGKPVTVTEQVPVTIVNTEVQVQTVEKTVEKPQTIEKTVEKPVTVEKTIEKPVTVEKTIENVVTAISTVL
STYVSEKEGKSVTITEERPVTVVETHMSVETEVQTQTEVQVQTQTVVSTVEQTHTIVSTVEHVVTSVSTVLSTYISEREG
QSVTITEERPVTVINTEYEPTTIVQTELLPTTIVHTEVKPTTVYETVVSTYATTYATTYTTEKEGATVTVTEQVTEQVPT
TVVQTQVHTEVQVKTETEVQVKPTTVYETIVSTYATTYATTYTTEKEGATVTVTEQVTEQIPTTVVQTQVHTEVQTQIQT
EVQTHTVVSTIENVVTTISTAHHTFTTEKEGQTVTITEAIPTTIVNTELKPTTIIKTEVVPTTETVVSEYTITQTFEKPV
TVVTTYTTSLEGSVATVTETISTIATVVTPTTVVSVSPVPTTVYFTHTTTEKGEVVTVTDAVTIHPEPCVIYSTITSVKE
GTTVTISEPIVTIYTTPEIPTHAPEPTTPEPTLVPTKSSILGVPNTSEAPETTLSPVAPPPPSVCVESSTTVNNIGETVT
VTVSCPETALPTLPQVNGAISNIPSSTMGTFVALAAAIFFAM

GO term prediction

Biological Process

None predicted.

Molecular Function

None predicted.

Cellular Component

None predicted.